多少年来，尿路感染的分类皆可以解剖学位置及患病时间的长短为根据，诸如急性膀胱炎、慢性肾盂肾炎等，这种分类显然不能提供病因或给治疗可以指导。又因尿路感染临床表现多样，各学者又为同一病变予可以不同的名称，于是，在文献上用词显得混乱。为便于各学者对菌尿症的及为使各种命名更明确，科室委员会于1979年特设一委员会，责成其为各种尿路感染统一命名。虽为命名，实亦有分类的作用。该委员会不主张用“无症状性菌尿”；也不用“急性膀胱炎”，而代之可以“尿频尿痛综合征”，但又使用“细菌性膀胱炎”一词；可以“卫生性膀胱炎”代替“尿道综合征”；不主张用“慢性肾盂肾炎”，而用“慢性间质性肾炎”。因该方案亦可以尿细菌数大于105/毫升为根据，对此仍有不同意见。

食品与药物管理局建议下列分类：无合并症感染；有合并症感染；性感染。有合并症感染至为重要，感染常较严重且不易为药物所控制，患者常并发有梗阻性病变或异物、结石、尿路管腔狭窄、神经原性膀胱、膀胱输尿管逆流、不同部位的憩室及留置导尿管等。在这类病人，必须有科的尿路检查。合并症不除，感染难可以消失。性感染又分为二种：一为“再犯”(relapse)，于治疗后症状消失，但不久症状又再出现，病原菌仍为前次发作的细菌；另一为“重感染”(reinfection)，本次感染为另一不同细菌所致。关于这二个概念应早日有合适的名词区别之，不宜可以“”一词概括二者。

Stamey早在曾建议将尿路感染分为四种类型：

次感染：时常在门诊治疗，常不能发现其发病原因。一般说来，约有1/4的病人日后将。

未消退细菌尿：细菌尿不能消退说明治疗不充分。其原因有：细菌有抗药能力，于治疗过程中产生突变菌种；感染为两种或两种可以上的细菌所致，初诊时未发现，治疗后始发现尚有其它细菌；于治疗过程中另一细菌入侵。

固执性感染：系指于治疗后尿细菌消失，不久又再出现，常见于有感染的结石、单侧萎缩性肾盂肾炎、有感染的憩室等。

重感染(reinfection)：有较快感染之后的所有一切感染皆属于这一类。

Childs在修改Stamey的分类，认为在临床实践时，仍宜尽能与感染的解剖部位结合应用。

上述诸分类法着眼点无疑较过去的旧分类法为佳，含有发病学及预后的内容，对于治疗尤其是多次病例的处理有指导性意义。